月を破壊し、地球をも破壊すると予告した超生物・殺せんせー。
暗殺を託されたのは椚ヶ丘中学校の落ちこぼれ3年E組、通称“エンドのE組”

何故かE組の担任となった殺せんせーは常識外れの指導で彼らを導き、
卒業を目前に控えた今ではE組を笑う人間も随分と少なくなった。

彼らがやり残したことはただ１つ、殺せんせーの暗殺。
その期限まで、残された時間はあと15日――。

E組の教室では生徒と殺せんせーがこれまでの1年間を振り返っていた。

アート、水泳、暗殺スキルを活かした課外活動、バレンタインの恋模様、先生の秘密のアフターファイブ。
それぞれの思い出が、教室いっぱいに広がっていく。

テレビシリーズでは描かれなかったエピソードの数々を、10周年を記念して完全新規で映像化。

成長を遂げた生徒たちが、改めて見つめる“暗殺教室”での1年。
彼らに残された最後の時間に、殺せんせーが届けるものとは――。